Nápad vytvořit projekt metalové opery se Sammetovi v hlavě zrodil během turné Theater of Salvation, na které skupina Edguy vyrazila v roce 1999. V průběhu koncertní šňůry si Sammet své myšlenky pečlivě zapisoval do diáře a ihned po skončení turné se tak mohl pustit do realizace projektu, k níž přizval řadu známých hudebníků – mezi nimi Michaela Kiskeho, bývalého zpěváka skupiny Helloween, kytaristu Kaie Hansena nebo zpěváka Roba Rocka ze skupiny Gamma Ray.

Základní sestavu formace Avantasia utvořili klávesista a aranžér Tobias Sammet, kytarista Henjo Richter, baskytarista Markus Grosskopf a bubeník Alex Holzwarth. V tomto složení vydala skupina v roce 2001 své první album s názvem The Metal Opera, po němž následovala druhá část projektu - album The Metal Opera Part II.

V lednu 2008 vydala skupina třetí album s názvem The Scarecrow, jenž vyprávělo příběh o strašákovi, který hledá přátele. Na desce se podíleli zakladatel německé hard rockové skupiny Scorpions a kytarista Rudolf Schenker, německý kytarista, basista a producent Sascha Paeth, bubeník Eric Singer a zpěváci Bob Catley, Jön Lande, Michael Kiske, Alice Cooper, Roy Khan, Amanda Somerville a Oliver Harmann.

V dubnu 2010 vyšla další dvě alba skupiny – The Wicked Symphony a Angel of Babylon. Desky jsou pokračováním příběhu z třetího alba a společně jsou tak tato tři alba označována jako The Wicked Trilogy (v české překladu Hříšná trilogie).